精子是承担受精功能的高度特化生殖细胞,其功能依赖头部、颈部和鞭毛等区域的结构分工与协调配合。解析这些结构在近天然状态下的三维组织方式,有助于理解精子发育、鞭毛运动和受精过程,以及男性不育相关结构异常的形成基础。近年来,冷冻电子断层成像(cryo-ET)推动了哺乳动物精子轴丝的原位结构研究,但公开数据资源仍相对不足。现有数据多集中于特定区域,缺少兼具规模、质量和区域覆盖度的数据集,制约了数据复用、跨区域比较及自动化分析方法的开发。
2026年11月1日,中国科学院生物物理研究所孙飞团队在《Data Express in Life Digitalization》发表题为"A large-scale in situ cryo-electron tomography dataset of mouse sperm"的数据快报,正式发布小鼠精子超微结构资源库(Mouse Sperm Ultrastructure Resource, MSUR)。MSUR由1,413套野生型C57BL/6J小鼠精子的断层重构图及相关组成,覆盖精子头部、颈部和中段、主段、尾段等主要区域 (图1),是一个面向精子原位超微结构研究和计算分析的大规模数据资源。

图1:MSUR中小鼠精子不同部位的冷冻电子断层重构图
文章系统介绍了精子样品制备、冷冻聚焦离子束减薄、倾转序列采集及断层图重构的流程,提供了断层重构图、采集元数据、对齐参数、重构断层图和数据质量控制记录。研究团队还整理了每套数据的采集条件与基本信息,并说明所用仪器、倾转策略及关键处理参数,便于研究者了解数据来源、筛选所需区域,并根据自身研究目的重新处理和分析数据。此外,数据集还配套了相应的说明文件以及详细的处理流程说明。通过共享从原始数据到重构结果的多个环节,MSUR为研究结果的核查与数据的持续复用提供了基础。
研究组与合作者围绕MSUR已取得一系列成果:揭示小鼠精子双联微管的稳定机制(Cell Discovery, 2023),解析中央微管结构及CFAP47缺陷与弱精症的关系(Cell Research, 2025),并发现连接辐射辐条的TRiC伴侣蛋白通过促进局部合成蛋白的折叠维持精子鞭毛运动(Molecular Cell, 2026)。
MSUR可支持多种类型的后续研究,包括用于精子超微结构的原位观察与比较、亚断层平均,以及自动颗粒识别和图像分割等方法的开发;其中的野生型数据也可作为研究突变或疾病相关结构变化的参照(图2)。

图2:MSUR的应用示例
中国科学院生物物理研究所孙飞研究员、朱赟研究员为论文的共同通讯作者,孙飞组博士生王蓉为论文第一作者,孙飞组殷国良博士与台林华博士也参与了相关工作。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的支持。
文章链接:
https://doi.org/10.3724/DeLD-20260014
数据集链接:
CSTR: https://cstr.cn/31253.11.sciencedb.00zls
DOI: https://doi.org/10.57760/sciencedb.00zls
(供稿:孙飞研究组)
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