2004年
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5 月 1 6 日 生物物理所开放院重点实验室,举办研究所 第一届“北京公众科学日”活动。

5 月 2 5 日 由科技部、中国科学院和卫生部联合投资共 建的北京磁共振脑成像中心正式成立,中心依托单位是生物 物理所。
6 月 5 日 生物物理所参与承办的“第十届国际生物大 分子结晶大会”在北京召开,梁栋材任大会名誉主席,饶子 和任大会主席。

蛋白质与多肽药物实验室成立。2011年,入选所重点实验室。

8 月 2 7 日 诺贝尔生理学或医学奖获得者利兰 · 哈特韦 尔来访。

11月10日 常文瑞获何梁何利基金科学与技术进步奖。 1 2 月 1 0 日 饶子和当选为第三世界科学院院士。
陈霖获求是科技基金“杰出科学家”奖。
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