2014年11月17日下午,应许瑞明研究员邀请,法国国家科学院(CNRS)巴黎Jacques-Monod研究所的Terence Strick博士来访生物物理所,并做了题为“Real Time, simultaneous monitoring of the composition and catalytic state of multiprotein assemblies”的学术报告。该报告为生物物理研究所“贝时璋讲座”的系列报告之一。
DNA 的转录偶联修复通过转录复合物来定位和识别DNA损伤,并进行修复。Strick博士通过磁镊技术在单分子层面对这一复杂的过程进行了研究,他的研究团队将单一的 DNA分子伸展到磁场中,并观察单个蛋白作用于活跃和受损基因时的情况。他们发现,在这一过程中,一个名为Mfd的DNA转位酶起了重要作用:首先,RNA polymerase 会识别DNA损伤并驻足一段时间,Mfd会识别这一RNA polymerase 并利用ATP水解的能量来使RNAP-DNA elongation复合物分离。接下来,Mfd招募核酸酶UvrA来对DNA损伤位点进行修复。他们首先通过磁镊分辨出了完整的DNA转录过程中存在的几种中间状态,当DNA损伤存在时,RNAP驻足在DNA上而使其无法回到转录前的初始状态。在有RNAP驻足的DNA中加入Mfd后,DNA可以通过一个中间态而回到初始状态。他们对此中间状态的寿命和解离常数等进行研究并提出了Mfd识别RNAP与受损DNA这一过程的模型:首先,RNAP识别DNA 损伤位点并在此驻足,接下来Mfd识别有RNAP驻足的DNA,并依靠ATP水解来使错配的DNA区域结构改变,从而移除在此驻足的RNAP。接下来 Mfd可以通过招募UvrA等蛋白对受损DNA位点进行修复。
Strick博士的这一研究从单分子层面直观地揭示了DNA损伤识别的过程,并使人们意识到,修复受损基因的过程所需步骤可能比我们之前想象的多。
报告结束后,与会老师同学和Strick博士进行了热烈的讨论。
Terence Strick博士
许瑞明研究员主持报告会
报告会现场
(供稿:许瑞明研究组)
(报道:科技处)
(摄影:王强)