6月21日,应非编码核酸重点实验室娄继忠研究员邀请,美国密苏里哥伦比亚大学(University of Missouri-Columbia)的陈世杰教授来访生物物理研究所,并做了题为“Predicting RNA Folding: From 3D Structures to microRNA detection”的精彩报告,娄继忠研究员担任主持人,陈润生院士,蒋太交研究员,秦燕研究员,王艳丽研究员等众多科研人员及学生参加了报告会。
报告中,陈世杰教授讲述了他们实验室开发的RNA结构的预测方法以及利用该方法完成的相关工作,并着重介绍了他们的预测方法的核心部分:“Vfold model”。在该模型中,将导致复杂RNA构象空间的核酸的多个扭转角进行了简化,缩减为三个有效键。在考虑了RNA的loop区之间的相互作用后,利用配分函数计算构象自由能,从而根据RNA序列预测其2D结构。此外,利用该模型还可以准确地预测RNA的3D结构。陈教授开发出的预测方法在世界范围内得到广泛承认,参加了两届Critical Assessment of RNA Structure Prediction (CASP),都获得了优秀的成绩。通过成功预测RNA的三维结构,进一步证明了陈教授开发的预测方法的可靠性。最后,陈教授还就Micro RNA-Gene的结合自由能以及三维结构的预测发表了自己的看法并介绍了他们的工作进展。
陈教授的报告深入浅出、内容丰富,使广大师生受益匪浅。报告结束后,与会的老师和同学与陈教授进行了热烈的讨论。之后陈教授参观了相关实验室,并与老师学生们进行了学术交流。
陈世杰教授
(供稿:非编码核酸重点实验室)
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