周海宁 / 博士 研究员 博士生导师
中国科学院生物物理研究所,表观遗传调控与干预重点实验室,研究组长
研究方向:表观遗传学
电子邮件:zhouhaining@ibp.ac.cn
电  话:010-64888786
英文版个人网页:http://english.ibp.cas.cn/sourcedb/rck/EN_xsszmZ/202208/t20220810_341351.html
简历

2006 - 2010  中山大学,生物技术系,学士

2010 - 2016  北京大学,细胞生物学,博士

2016 - 2022  美国霍华德·休斯医学院/哈佛医学院,Danesh Moazed博士实验室,博士后

2022 - 至今   中国科学院生物物理所,研究员

获奖及荣誉

2022年  获得哈佛大学优秀华人学者奖

社会任职
承担项目情况

  表观遗传学研究的重要性在于:对于多细胞生物来说,每一种细胞都拥有同一套DNA,而这套DNA通过表达不同的基因决定细胞的命运和细胞的功能,因此研究表观遗传学对于我们认识细胞分化,个体发育,以及个体对环境刺激的反应都至关重要。

1. 基因表达的表观遗传调控机制

  表观遗传学领域一大关键问题是:基因表达调控是如何实现的以及基因表达调控如何决定细胞命运。因此,本实验室的研究通过生物化学、分子生物学、基因编辑、二代测序、生物信息学分析等手段,着重于更全面更深入地揭示基因转录沉默的表观遗传分子机制以及表观遗传调控系统在细胞命运控制中的作用。

2. 免疫细胞命运的转变机制

  免疫细胞是人体对抗病原体感染的主要力量,也是多种人类疾病发生(纤维化,肿瘤等)的参与者,免疫细胞的一个重要特征是其高度的可变性,但其细胞命运决定的机制和细胞功能仍然不清楚,本实验室将深入研究免疫细胞的分化、激活、失活、耐受等机制。

研究成果:

  周海宁于2016-2022年师从哈佛医学院表观遗传学专家Danesh Moazed教授(美国科学院院士),致力于基因表达调控的机制和细胞命运决定的研究;近几年的研究揭示了多梳(polycomb)在转录起始后层面介导基因沉默的新机制,具体如下:

   该工作鉴定出一个含有七个亚基的新型蛋白复合体Rixosome,而多梳复合物将Rixosome招募到启动子区域,Rixosome亚基之一LAS1L是RNA内切酶,它可以切割由 RNA 聚合酶 II 新合成的RNA,被切割的新生 RNA 进一步被Rixosome 另一个亚基NOL9 (一种 5'-末端 RNA 激酶)磷酸化,磷酸化的 5'-末端 RNA 被下游因子 XRN2(一种 5'-3' 外切核糖核酸酶)识别, XRN2 介导新生 RNA 的完全降解,最终引发RNA Pol II 从DNA 模板上解离。

  目前教科书描述的基因沉默是通过阻止新 RNA 的转录起始来介导的,而Rixosome的功能却表明了基因表达调控的新概念:转录起始后通过降解新生RNA达到阻断基因转录的新机制。该研究发表于Nature (2022)和Cell Reports (2023),并且受到Nature news & viewsNature Chemical Biology的高度关注并发文介绍。

1. Shafiq TA, Yu J, Feng W, Zhang Y, Zhou H, Paulo JA, Gygi SP, Moazed D. Genomic context- and H2AK119 ubiquitination-dependent inheritance of human Polycomb silencing. Sci Adv. 2024 May 10;10(19):eadl4529.

2. Li Q, Chen Q, Zheng T, Wang F, Teng J*, Zhou H*, Chen J*. CCDC68 Maintains Mitotic Checkpoint Activation by Promoting CDC20 Integration into the MCC. Adv Sci (Weinh). 2024 Jul 17:e2406009.

3. He C, Zhou W, Jin X, Zhou H*. Derepressing of STAT3 and USP7 contributes to resistance of DLBCL to EZH2 inhibition. Heliyon. 2023, 10: e20650.

4. Zhou H*, Feng W, Yu J, Shafiq T , Pualo J, Zhang J, Luo Z, Gygi S, Moazed D*. SENP3 and USP7 regulate Polycomb-rixosome interactions and silencing functions. Cell Rep. 2023 Apr 3; 42(4):112339. (*Corresponding)

5. Zhou H, Stein C, Shafiq T, Shipkovenska G, Kalocsay M, Pualo J, Zhang J, Luo Z, Gygi S, Adelman K, Moazed D. Rixosomal RNA degradation contributes to silencing of Polycomb target genes. Nature. 2022. 7904:167-174 (Reported in Nature News & views entitled "An Added Layer of Repression for Human Genes") (Highlighted in Nature Chemical Biology entitled "Silenced by Degradation")

6. Wang X, Paulo J, Li X, Zhou H, Yu J, Gygi S, Moazed D. A composite DNA element that functions as a maintainer required for epigenetic inheritance of heterochromatin. Molecular Cell. 2021. 3979-3991.e4.

7. Zhou H*, Zheng T*, Wang T, Li Q, Wang F, Liang X, Chen J, Teng J. CCDC74A/B are K-fiber crosslinkers required for chromosomal alignment. BMC Biology. 2019. 17 (1), 73

8. Zhou H, Wang T, Zheng T, Teng J, Chen J. Cep57 Is a Mis12-interacting Kinetochore Protein Involved in Kinetochore Targeting of Mad1-Mad2. Nature Communications. 2016. 7:10151.

9. He R*, Huang N*, Bao Y, Zhou H, Teng J, Chen J. LRRC45 Is a Centrosome Linker Component Required for Centrosome Cohesion. Cell Reports. 2013, 4:1100-1107.

10. He R*, Wu Q*, Zhou H*, Huang N, Chen J, Teng J. Cep57 Protein Is Required for Cytokinesis by Facilitating Central Spindle Microtubule Organization. Journal of Biological Chemistry. 2013, 20:14384-14390.

11. Wu Q*, He R*, Zhou H, Yu C, Zhang B, Teng J, Chen J. Cep57, a NEDD1-binding pericentriolar material component, is essential for spindle pole integrity. Cell Research. 2012, 12:1390-1401.

(资料来源:周海宁研究员,2024-09-10)

在职职工
  • 季明明
    2018年入职,助理研究员,研究方向:染色质的转录调控与细胞命运的决定。
  • 段富刚
    2024年入职,助理研究员,研究方向:免疫细胞与疾病关系的研究。
  • 陈红
    2010年入职,高级工程师,科研财务助理。
博士后
  • 潘佳宾
    博士后,研究方向:表观遗传调控与细胞命运决定。
在学学生
  • 王一鸣
    2023年入学,博士研究生,对生物信息学、染色质折叠、基因表达调控感兴趣。
  • 赵国秀
    2020年入学,硕博生,方向:基因表达的表观遗传学调控。
  • 张德臻
    2020年入学,直博生,对免疫、疾病和细胞命运的转变感兴趣。
  • 宋嘉琳
    2021年入学,硕博生,方向:基因表达过程中表观遗传的调控机制。
  • 廖灵灵
    2021年入学,硕博生,方向:疾病与表观遗传学。
  • 曹若凡
    2022年入学,硕士生,方向:基因表达的表观遗传学调控。
  • 刘欣杰
    2022年入学,硕博生,方向:生物信息学,小鼠胚胎发育,基因表达的表观遗传学调控。
  • 孟煜睿
    2022年入学,硕博生,方向:免疫活动过程中的表观遗传调控。
  • 杜肇琦
    2023年入学,硕博生,对发育和疾病相关的表观遗传调控感兴趣。
  • 杨禧龙
    2023年入学,直博生,对发育过程中表观遗传调控感兴趣。
毕业学生
2024年8月-庆祝实验室组建两周年
2024年1月-集体过大年
2023年9月-麦霸嗨
2023.年8月-庆祝实验组建一周年
2023年5月-香山
2022年10月-活力运动