北京市重点实验室和工程技术中心是首都技术创新体系的重要组成部分，是开展高水平基础研究、应用基础研究，从事前沿技术和共性关键技术研究，促进重大科技成果转化和产业化的重要科技创新基地，是建设以企业为主体、市场为导向、政产学研用相结合的技术创新体系的重要载体，同时也是为聚集和做强一大批科技创新基地、进一步完善首都科技研发和成果产业化重要布局。
2013年5月，生物物理研究所蛋白质与多肽药物重点实验室凭借自生实力，被北京市科委正式认定为“北京市生物大分子药物转化工程技术中心”，成为北京市生物大分子药物转化工程技术中心的依托单位,成为首都技术创新体系的重要组成部分。
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