流感是严重威胁人类健康的传染病,每年季节性流感的流行和传播会导致全球5-15%的人群感染,25-50万人的死亡。目前预防与控制流感最有效的方法是接种流感疫苗,但是由于流感病毒极快的变异速度,导致不能及时与准确地推荐与流行病毒相匹配的流感疫苗株。
中国科学院生物物理研究所蒋太交课题组在流感病毒计算生物学模拟方面有着十分丰富的经验,与国家流感中心舒跃龙课题组有长期密切的合作。两个课题组在国家“十一五”传染病重大专项的大力支持下,在国际上首次直接从流感病毒主要抗原表面蛋白(HA)序列出发,通过整合血凝素蛋白的12个结构和理化特征,发展出一个新的计算方法分析流感病毒抗原变异和进化,快速准确地选择流感疫苗株。研究者还利用该方法系统描述了H3N2流感病毒在中国大陆地区的流行规律,这不仅大大加深了季节性流感在中国内传播规律的了解,而且为中国流感疫苗株推荐和防控提供了更科学的技术方法。
该研究成果在线发表在2012年2月28号的Nature Communications上(http://www.nature.com/ncomms/journal/v3/n2/full/ncomms1710.html), 被选为亮点文章和新闻评述(http://www.natureasia.com/en/research/index/highlight/id/1689/)。同时,3月2日新华社以“我国科学家发明流感疫苗株快速选择新技术”予以报道(http://news.xinhuanet.com/tech/2012-03/02/c_111596488.htm)。文章中提出基于序列分析流感抗原演化规律及用于疫苗株推荐的新方法,将在我国及全球的流感预防与控制中发挥重要作用。
图1:将发展的病毒抗原变异预测模型(PREDAC)与大规模HA测序相结合,开发出的针对中国地区的自动高效的疫苗推荐策略。
(供稿:蒋太交课题组)