4月25日,Science杂志以长幅研究论文(Research Article)形式发表了朱平研究组和李国红研究组合作利用冷冻电镜三维重构技术解析的30nm染色质左手双螺旋高清晰三维结构这一重要研究成果。
61年前的同一天(1953年4月25日),沃森和克里克发表的DNA双螺旋结构模型使生命科学研究深入到分子层次,开启了分子生物学时代。但任何有关DNA的生命活动都是在DNA及其所缠绕的组蛋白组装形成的染色质这个结构平台上进行的。由于缺乏一个系统性的、合适的研究手段和体系,目前对于30nm染色质纤维这一超大分子复合体的精细结构组成还具有很大争议,染色质的高级结构研究一直是现代分子生物学领域面临的最大挑战之一。
近年来,冷冻电镜(cryo-EM)技术在结构生物学领域发展迅速,为研究30nm染色质的高级结构及其调控机制提供了一个最为合适的研究工具。依靠多年来在冷冻电镜高分辨率三维重构、30nm染色质及表观遗传调控等领域的长期工作积累,朱平研究组和李国红研究组合作成功建立了一套30nm染色质体外重建和结构分析平台,利用冷冻电镜单颗粒三维重构方法率先解析了30nm染色质纤维的高分辨率三维结构,这是目前为止最为清晰的染色质高级结构图。该结构揭示了30nm染色质纤维以4个核小体为结构单元;各单元之间通过相互扭曲折叠形成一个和DNA右手双螺旋类似的左手双螺旋高级结构(图1);结构单元之间的空隙可能是组蛋白修饰、染色质重塑等表观遗传现象发生的重要调控区域。同时,该研究首次明确了连接组蛋白H1在30nm染色质纤维形成过程中的重要作用。这些研究结果为预测体内染色质结构建立的分子基础以及各种表观遗传因素包括组蛋白变体、组蛋白化学修饰等对染色质结构调控的可能机理提供了可靠的结构基础。本研究论文评审人评论说“30nm染色质结构是最基本的分子生物学问题之一,困扰了研究人员30余年”,该结果是“目前为止解析的最有挑战性的结构之一”,“在理解染色质如何装配这个问题上迈出了重要的一步”。
图1. 30nm染色质左手双螺旋结构模型
(Song et al, Science,25 April 2014: Vol. 344 no. 6182 pp. 376-380,research article)
Science编辑部以“Double Helix, Doubled”为题对本论文进行了小结介绍。来自DNA双螺旋结构模型的发源地—英国剑桥大学的Andrew Travers教授在同期Science杂志上为本文撰写了题为“The 30-nm Fiber Redux”的视点评论。
本研究工作是中科院生物物理所朱平研究组、李国红研究组、许瑞明研究组长期合作获得的重要成果,朱平研究组的博士生宋峰、李国红研究组的副研究员陈萍为论文的共同第一作者,李国红研究员和朱平研究员为共同通讯作者,朱平组博士毕业生孙大鹏、许瑞明组副研究员王明珠、李国红组博士生董立平、梁丹,以及许瑞明研究员为共同作者。本研究得到了科技部973计划,基金委重大研究计划项目和重点项目以及中科院战略性先导科技专项(B类)等的资助。
相关链接:
1. http://www.sciencemag.org/content/344/6182/376
2. http://www.sciencemag.org/content/344/6182/370
(供稿:李国红、朱平课题组)
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