5 月 4 日  英 国《生物化学杂志 》(Biochemical Journal) 中国编辑部成立大会在生物物理研究所召开。

5 月 25 日 第五组《中国现代科学家》纪念邮票举办首发仪式，生物物理学家贝时璋入选。同时入选的还有钱学森、侯祥麟、钱三强等。

5 月 27 日 美国宾夕法尼亚大学校长Amy Gutmann与中国科学院签署了合作备忘录，并与生物物理所签属合作框架协议成立脑成像联合研究中心。

6 月 14 日 诺贝尔化学奖获得者Ada Yonath 来访，并作学术报告。

7 月 13 日 民政部同意中国认知科学学会筹备成立，挂靠生物物理所。11月30日，中国认知科学学会成立大会暨第一次全国会员代表大会召开，选举陈霖为第一届理事长。2013年1月18日，民政部准予成立登记。

10 月 28 日 诺贝尔化学奖得主Thomas A.Steitz 和 Venkatraman Ramakrishnan来访，并作学术报告。

10 月 29 日 非编码核酸所重点实验室成立。

10月30-11月3日 第17届国际生物物理大会在北京国家会议中心召开。由国际生物物理联合会 (IUPAB) 主 办，中国生物物理学会和生物物理所共同承办。饶子和当选 IUPAB 候任主席(2014-2017)。

交叉科学所重点实验室成立。2014年被北京市科委评定为“北京市生物医学分子检测工程技术研究中心”。

生物物理所被中组部授予国家海外高层次人才创新创业基地。