细胞和组织结构的三维重够技术分析可以更好地有助于研究者理解结构和功能之间的关系。然而受某些技术条件所限，目前对许多生物系统特别是较大尺度的生物组织来说，该技术的应用仍然有限。成像中心同合作者开发的基于连续切片自动收集光学显微成像（automatic collector of serial sections for Light microscopy，AutoCUTS-LM）三维重构技术流程包括：样品制备、自动采集连续切片，建立组织的光学显微图像库，3D组织重建和高级分析。其中光学显微成像对切片的平整性，收集带的透光度、染色强度等要求较高。连续半薄切片极其容易出现褶皱，从而影响图像质量。为了解决这个难题，本研究系统比较了不同的切片厚度、切片速度、环境温度和湿度、收集带材质及亲水化处理条件、收集带粘贴方式等因素对切片平整度的影响；比较了染色液的浓度、染色时间、温度、方式等对图像衬度的影响。最终，我们与合作者利用此技术实现了对数十个大脑皮层组织（1mm3）的三维结构分析，并发现其中的锥体细胞排列成柱状的三维结构。该技术还可以对发育生物学和病理学中的其它细胞或结构进行充分鉴定。

　　Publication：

　　Larsen NY, Li X, Tan X, Ji G, Lin J, Rajkowska G, M?ller J, Vihrs N, Sporring J, Sun F, Nyengaard JR. Cellular 3D-reconstruction and analysis in the human cerebral cortex using automatic serial sections. Commun Biol. 2021;4(1):1030.