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生物成像中心2016年度常规技术培训顺利完成

发布时间:2016-10-18

  2016年9月,北京生命科学大型仪器区域中心年度常规仪器技术培训如期举办,该培训为北京生命科学大型仪器区域中心面向用户,主要就区域中心仪器设备的基本原理、常规实验方法、基本操作流程和操作安全规范展开培训,其中科学研究平台生物成像中心承担培训课程主要包括:电子显微成像技术及电镜样品制备技术,激光扫描共聚焦与结构光照明超分辨荧光显微成像技术,高性能计算机集群应用以及图像三维数据处理技术等培训。

  本次常规培训的主要内容有:

  一,电子显微成像技术

  生物成像中心现已配有透射电子显微镜四台(120kV热发射透射电子显微镜FEI Tecnai Spirit, 200kV 热发射透射电子显微镜FEI Tecnai 20和先进的300kV 场发射低温透射电子显微镜FEI Titan Krios, 200kV 场发射低温透射电子显微镜FEI Talos ),双束扫描电子显微镜一台(FEI Helios Nanolab 600i, 配备了Quaroum PT3000低温样品载台),围绕这些显微设备,生物成像中心还配备了完整的用于生物超微结构研究的样品制备系统。本年度电子显微成像技术常规培训主要样品制备技术和电镜技术应用,其中电镜技术应用培训内容包括:透射电镜基本原理及应用(初级)(郭振玺老师主讲),透射电镜电子光学及合轴方法以及低温电镜技术(中级)(黄小俊老师主讲),双束扫描电镜的基本原理及应用(张建国老师主讲); 样品制备技术培训内容包括:常规超薄切片样品制备技术(王莉老师主讲),冷冻切片免疫标记技术(孙磊老师主讲),高压冷冻技术(李喜霞老师主讲),碳支持膜制备及样品负染色技术(陈永圣老师主讲) 。

 

图1.低温透射电镜技术及三维重构的数据收集培训现场
 
图2.双束扫描电子显微成像技术培训现场
 
图3.电镜样品制备技术(冷冻切片免疫标记)培训现场
 
图4.电镜样品制备技术(超薄切片技术基本原理及操作)培训现场
图5.电镜样品制备技术(高压冷冻及冷冻替代)培训现场
图6.碳支持膜制备及样品负染色技术培训现场

  二,激光扫描共聚焦与结构光照明超分辨荧光显微成像技术

  生物成像中心荧光成像小组现配备有全内反射荧光(TIRF)显微镜一台,激光扫描共聚焦显微镜两台(FV1000,FV1200),转盘共聚焦显微镜两台(3I Marianas XL,Andor Revolution XD),双光子显微镜一台(FV1000MPE),多功能活细胞工作站一台(IX81/MicroPoint),以及结构光照明超分辨荧光显微镜一台(Delta Vision OMX)。其中,激光共聚焦显微成像技术培训由滕岩老师主讲,内容包括:细胞荧光样品制备中常用荧光探针及其标记方法;荧光显微镜,共聚焦显微镜仪器的原理及应用;生物荧光样品图像的采集技术。学员上机实习内容包括:宽场荧光显微镜的使用,以及激光扫描共聚焦显微镜的使用。结构照明超分辨荧光显微成像技术培训讲座由李硕果老师主讲,讲座中主要介绍了结构照明成像原理以及样品制备方法与注意事项,随后的上机实习为学员演示了OMX成像系统的操作步骤、要点及实验室管理注意事项。

 
图7.激光扫描共聚焦技术培训现场

图8.结构照明超分辨荧光显微成像技术培训现场

  三,高性能计算机集群应用以及电镜数据处理和三维重构技术

  中国科学院生物物理所筹建的高性能计算中心主要是为了满足本研究所科研活动中日益增长的高性能计算需求,包括:透射电镜的数据收集、数据初步处理、三维重构,质谱原始数据的处理,晶体结构解析,分子动力学,分子建模,结构预测,以及其他生物信息学相关的大规模计算等等。本次培训中,高性能计算集群应用培训由凌伦奖老师负责,主要内容包括:主力机群浪潮TS10K的架构简介;规章制度及收费办法;高性能计算机集群浪潮TS10K的使用方法及联机实习。电镜数据处理和三维重构技术由丁玮老师负责,主要内容包括:单颗粒三维重构与模型搭建。

图9.高性能计算集群培训现场

图10.电镜数据处理和三维重构技术培训现场


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