中国科学院感染与免疫重点实验室的总体目标是，面向国家重大传染病防治的战略需求，开展乙肝、丙肝和艾滋病等重大病毒性传染病防治的基础理论与应用研究。着眼病毒感染早期的早期事件，研究病毒与宿主相互作用的分子机理，病毒感染早期的免疫应答机制、免疫病理机制和病毒清除机制，揭示免疫生物学基础理论，并为重大传染性疾病防控科技的建设与国家普惠健康体系的发展提供技术支撑。在此基础之上，针对性开发清除感染的治疗性抗体，开展小分子抗病毒药物设计，通过源头创新，推动生物医药产业的发展。

　　实验室目前固定人员54名（研究人员43人，技术人员10人，管理人员1人）；流动人员100人（在站博士后11人、硕博研究生87人、合作研究员2人）。

　　实实验室在组织科研与研究生培养等方面十分注重并体现团队精神。课题组联合承担科技部重大科学研究计划及中科院重点部署项目；联合建设和管理免疫缺陷动物实验中心、生物安全II级实验室，共同建设与维护公用数据库、共享实验资源与实验数据，共同组织召开国际研讨会等。本实验室还在老一辈院士的领导下，建立结构免疫学交叉研究项目与课题，取得了很好的效果并极大带动了研究所的联合、交叉科研氛围。

　　实验室正在实践中青年人才的培养措施，包括推动新聘研究员担纲实验室学术、教育与管理专业委员会，锻炼能力的同时，强化了主人翁意识；倾斜支持助研、副研等申报各项经费和相对独立地组织风险系数高、任务繁重的科研活动，通过项目和研究生培养，推动中青年人才的培养。